Hai năm đã trôi qua kể từ cuộc đột kích của CCG vào Anteiku. Mặc dù bầu không khí ở Tokyo đã thay đổi đáng kể do ảnh hưởng ngày càng tăng của CCG, nhưng những con ma cà rồng vẫn tiếp tục gây ra vấn đề khi chúng bắt đầu thận trọng, đặc biệt là tổ chức khủng bố Aogiri Tree, những kẻ thừa nhận mối đe dọa ngày càng tăng của CCG đối với sự tồn tại của chúng.